Acesse o menu Configurações e, na área Nota Fiscal, desmarque a opção
Permitir quantidade zerada de itens em uma NF-e e salve a configuração.
Após desmarcar essa opção, ao emitir uma NF-e não será permitido que a nota fiscal seja enviada com as quantidades zeradas.
Caso ainda possua alguma duvida, não deixe de entrar em contato com nosso suporte técnico.
É sempre um prazer ajuda-los!